Теоретически, исправная антивирусная программа со свежими базами может в значительной мере обезопасить вашу работу. Но любой, даже самый совершенный антивирус может ошибиться или не успеть внести заразу в свои фильтры. Поэтому дополнительным фактором защиты лучше включать свою голову вооруженную необходимыми знаниями.

Если вы получили файл из подозрительного источника, например по почте от незнакомого человека, то необходимо обратить внимание на его расширение и, если оно входит в предложенный нами список, то лучше его не открывать, а отослать на проверку в VirusTotal.

Программы:
.EXE - исполнимый программный файл. Большинство программ в Windows имеют именно такое расширение.
.PIF — это специальный файл, содержащий информацию для DOS-программ. Несмотря на то, что не содержат исполнимого кода, могут быть потенциально опасны.
.APPLICATION — установщик приложения, использующий технологию ClickOnce от Microsoft.
.GADGET — гаджет для отображения на рабочем столе в Windows Vista и 7.
.MSI — запускает процесс установки программы на вашем компьютере.
.MSP - установка обновлений для уже установленных программ.
.COM — программы для MS-DOS.
.SCR — файл скринсейвера.
.HTA — веб-приложение. В отличие от html приложений исполняемых в вашем браузере, могут быть опасны.
.CPL — файл Панели управления. Все элементы в панели управления имеют это расширение.
.MSC — файл консоли управления Microsoft. Такие приложения, как редактор групповых политик и инструмент управления дисками имеют расширение .MSC.
.JAR — исполнимый код для среды Java.

Скрипты:
читать дальше